《漁業水質標準》中，關于水質的測定有很多個項目，其中主要的5項是亞硝酸鹽、硫化氫、氨氮、溶解氧、酸堿度。

亞硝酸鹽

亞硝酸鹽是由氨氮經過硝化細菌轉化而來。當水體中亞硝酸鹽含量過多時，使得血紅蛋白載氧能力下降，魚類會中毒，出現拒食、浮頭、腮部發黑、黏液增多、腮絲嚴重充血腫脹等問題。

氨氮

氨氮主要來自餌料、排泄物、尸體等，這些物質經過分解形成有機形式的氮，最終轉化為氨氮。氨氮會導致魚群中毒，影響效益。

硫化氫

硫化氫是硫酸鹽被微生物分解而形成的，其會令魚類中毒，導致魚浮頭。

溶解氧

溶解氧少了會導致魚缺氧，而過高會導致氧飽和，容易得氣泡病。

酸堿度

當PH過高時，會增加氨氮毒性，抑制浮游植物的生長。由此可以看出水質PH的變化對水質有著重要影響。

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